Sự khác biệt chính giữa máy phay đứng và máy phay ngang là cách bố trí trục chính theo chiều dọc. Ngoài cách bố trí trục chính khác nhau, bàn làm việc có thể nâng lên và hạ xuống. Các dao phay được sử dụng trong máy phay đứng tương đối linh hoạt và có phạm vi ứng dụng rộng hơn. Có thể sử dụng dao phay đầu, dao phay đầu kẹp máy, mũi khoan, v.v. Có thể phay rãnh then, mặt phay, lỗ khoan, v.v. Máy phay ngang cũng có thể sử dụng nhiều loại dụng cụ cắt được đề cập ở trên, nhưng chúng không tiện lợi bằng máy phay đứng. Ưu điểm chính là có thể sử dụng khung treo để tăng cường độ bền của dụng cụ cắt (chủ yếu là dao phay ba mặt, dao phay tấm, v.v.). Có thể phay rãnh, mặt phay, cắt, v.v. Máy phay ngang thường đi kèm với đầu phay đứng, mặc dù không mạnh và cứng bằng máy phay đứng, nhưng đủ để xử lý các hoạt động phay đứng. Điều này làm cho chức năng tổng thể của máy phay ngang mạnh hơn máy phay đứng. Máy phay đứng không có tính năng này và không thể xử lý các phôi phù hợp để phay ngang. Năng suất cao hơn so với máy phay ngang.
Máy phay đứng thích hợp để gia công nhiều chi tiết khác nhau như bề mặt phẳng, bề mặt nghiêng, rãnh, lỗ, v.v. Đây là thiết bị gia công lý tưởng cho các ngành công nghiệp như sản xuất cơ khí, khuôn mẫu, dụng cụ, đồng hồ đo, ô tô, xe máy, v.v.
Tiết kiệm đầu tư thiết bị. Tuy nhiên, do số lượng công việc lẻ trong phay đứng cao nên máy phay ngang có đầu phay đứng này thực chất là treo đầu phay đứng mỗi ngày. Nó không phù hợp bằng máy phay đứng khi sử dụng để phay đứng. Phay ngang thường được sử dụng để gia công bánh răng, rãnh, khía, cắt, v.v. Máy phay đứng không chỉ được sử dụng để gia công phẳng mà còn cho các phôi có hình dạng hình học cao, thấp, cong và thẳng, chẳng hạn như khuôn. Phay đứng có thể thể hiện rất nhiều kỹ năng của nó.